翻堆操作促进发酵：一般物料会在发酵1～2天内（冬天慢一些），内部温度可以达到50～70℃以上，再保持到第3天或当温度开始下降时，即可开始翻堆操作，将底部和外部的物料导入堆内，几天后，如果温度再次上升，并开始下降时，则可再次翻倒，一般翻倒2次或视情况再多1次，温度保持相对恒定后发酵就完成了。
发酵成功的标志是：物料基本没有粪便臭味，或有淡淡的发酵后香味，堆内可见白色菌丝，生物填料变得脆弱柔软。
发酵时间：取决于所用原料的污染程度，或者说，如果粪料比较恶臭，则相应地发酵时间比较长，可能需要25天以上，如果相对比较新鲜的粪料，则发酵15天就可成功，且翻堆次数也少。
发酵好的有机肥一般可以直接作为生物肥，也可以进行造粒等，以提高其经济附加值。
或直接用于作有机肥使用，如果制作复合生物菌肥，需要根据不同作物特点，添加适量的氮磷钾等化肥进行复配制粒等，如果发酵后用于养殖蚯蚓，在完成发酵后每吨添加20公斤以上的营养糟渣如酒糟豆渣等拌匀，调水含量到65%，摊开透气3天后即可使用。
堆肥的制作过程其实非常简单，只需要把所有原料堆在一起然后用布盖住就好了。但是堆肥是有几种方式方法的，比如有地面式，平坑式，半坑式。那么这三种方式到底是怎样的呢？
首先我们来说说地面式，听名字就知道就是放在地面上的，一般这种方式适合气温高湿度大的南方地区。主要选择在地势较高且附近最好有水源的地方，这种方式一般都是堆高在2.1米左右，在放下原料钱先平整土地铺10-14厘米的草垫最好不过了。这种方式的原料读书选择动物粪便和人粪相结合的方式对起来的。然后在堆后五天进行加水作业，高温情况下7-15天翻一遍为上等。
堆肥发酵方法：主料：各种农作物秸秆、果渣、食用菌下脚料、谷壳、甘蔗渣、油菜杆、花生藤、红薯藤、稻草、麦秆、树叶、有机垃圾、锯末等；
配料：1吨物料加入5公斤尿素或者200公斤一周内的动物粪尿，以调节碳氮比，搅拌均匀后备用；将1包益富源生物菌肥发酵剂+2公斤红糖+20公斤水密封发酵3-7天后备用。
操作：辅一层秸秆混合物，放一层菌种混合物，再淋水湿透，简单耙拌一下，含水量调制60%左右；如此反复操作，直到辅完全部1000公斤料为止；简单薄膜覆盖上层，一般48小时温度最高上升到70℃并持续较长时间，第7～10天翻堆1次，一般6～15天左右完成，未切碎的物料需要20～25天完成发酵。
有机肥灭菌效果好
但是畜禽粪污却不可以直接还田，由于畜禽粪污中还含有大量的虫卵、病害菌，会影响农作物的生长发育。为此需要采用好氧发酵高达70℃的方式来将畜禽粪污进行处理。达到国家规定的《NY/T 525-2021》有机肥料行业标准，才可以成为有机肥还田。才能助农助产。
有机肥技术由于打破了传统发酵技术的投资高，运营高的难题，所以成为了畜禽粪污处理手段中的新方式，中海环境旗下的NCS智能分子膜发酵系统，相较于传统堆肥系统，由于土建需求少，所以投资成本降低70%；运营成本降低70%；可以露天发酵无臭味，即使不需要建立厂房也可以达到环保要求！且中海环境更在此基础上升级研发出可无人值守的远程操控系统，更大大降低了设备总体成本。是各大养殖企业的首选发酵设备。
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